Que son os péptidos que penetran nas células?

Os péptidos que penetran nas células son pequenos péptidos que poden penetrar facilmente na membrana celular.Esta clase de moléculas, especialmente as CPP con funcións de orientación, son prometedoras para unha entrega eficiente de fármacos ás células diana.

Polo tanto, a investigación sobre el ten certo significado biomédico.Neste estudo, estudáronse CPP con diferentes actividades transmembrana a nivel de secuencia, tentando coñecer os factores que afectan á actividade transmembrana dos CPP, as diferenzas de secuencia entre CPP con diferentes actividades e NonCPP, e introducir un método para analizar secuencias biolóxicas.

As secuencias CPPs e NonCPPs obtivéronse da base de datos CPPsite e de diferentes literaturas, e extraéronse péptidos transmembrana (HCPPs, MCPPs, LCPPs) con actividade transmembrana alta, media e baixa das secuencias CPPs para construír conxuntos de datos.En base a estes conxuntos de datos, realizáronse os seguintes estudos:

1, A composición de aminoácidos e estrutura secundaria de diferentes CPP e NonCPP activos analizouse mediante ANOVA.Descubriuse que as interaccións electrostáticas e hidrófobas dos aminoácidos desempeñaron un papel importante na actividade transmembrana dos CPP, e a estrutura helicoidal e o enrolamento aleatorio tamén afectaron á actividade transmembrana dos CPP.

2. No plano bidimensional mostráronse as propiedades físicas e químicas e as lonxitudes dos CPP con diferentes actividades.Descubriuse que os CPP e os NonCPP con diferentes actividades podían agruparse baixo algunhas propiedades especiais, e os HCPP, MCPP, LCPP e NonCPP dividíronse en tres grupos, mostrando as súas diferenzas;

3. Neste traballo, introdúcese o concepto de centroide físico e químico da secuencia biolóxica, e os residuos que compoñen a secuencia considéranse puntos de partículas, e a secuencia abstrúese como un sistema de partículas para a investigación.Este método aplicouse á análise de CPP proxectando CPP con diferentes actividades no plano 3D mediante o método PCA, e descubriuse que a maioría dos CPP se agrupaban e algúns LCPP se agrupaban con NonCPP.

Este estudo ten implicacións para o deseño de CPP e para comprender as diferenzas nas secuencias de CPP con diferentes actividades.Ademais, o método de análise do centroide físico e químico de secuencias biolóxicas introducido neste traballo tamén se pode utilizar para a análise doutros problemas biolóxicos.Ao mesmo tempo, pódense usar como parámetros de entrada para algúns problemas de clasificación biolóxica e desempeñar un papel no recoñecemento de patróns.