Esquema de deseño e solución da cadea peptídica polipeptídica

I. Resumo
Os péptidos son macromoléculas especiais de tal xeito que as súas secuencias son pouco habituais nas súas características químicas e físicas.Algúns péptidos son difíciles de sintetizar, mentres que outros son relativamente fáciles de sintetizar pero difíciles de purificar.O problema práctico é que a maioría dos péptidos son lixeiramente solubles en solucións acuosas, polo que na nosa purificación, a parte correspondente do péptido hidrófobo debe disolverse en disolventes non acuosos. Polo tanto, é probable que estes disolventes ou tampones sexan gravemente inconsistentes co uso. de procedementos experimentais biolóxicos, de xeito que os técnicos teñen terminantemente prohibido utilizar o péptido para os seus propios fins, polo que a continuación se exponen varios aspectos do deseño de péptidos para investigadores.

Esquema de deseño e solución da cadea peptídica polipeptídica
En segundo lugar, a elección correcta de péptidos sintéticos difíciles
1. Lonxitude total das secuencias reguladas á baixa
Os péptidos de menos de 15 residuos son máis fáciles de obter porque o tamaño do péptido aumenta e a pureza do produto bruto diminúe.Como a lonxitude total da cadea peptídica aumenta máis alá dos 20 residuos, a cantidade precisa do produto é unha preocupación fundamental.En moitos experimentos, é fácil obter efectos inesperados baixando o número de residuos por debaixo de 20.
2. Diminuír o número de residuos hidrófobos
Os péptidos con gran predominio de residuos hidrófobos, especialmente na rexión 7-12 residuos do extremo C-terminal, adoitan causar dificultades sintéticas.Esta é vista como unha combinación inadecuada precisamente porque na síntese se obtén unha folla B-fold."Nestes casos, pode ser útil converter máis de dous residuos positivos e negativos, ou poñer Gly ou Pro no péptido para desbloquear a composición do péptido".
3. Baixada de residuos "difíciles".
"Hai unha serie de residuos Cys, Met, Arg e Try que xeralmente non se sintetizan facilmente".Ser normalmente usarase como alternativa non oxidativa a Cys.
Esquema de deseño e solución da cadea peptídica polipeptídica

En terceiro lugar, mellorar a elección correcta do soluble en auga
1. Axuste o extremo N ou C
En relación aos péptidos ácidos (é dicir, cargados negativamente a pH 7), recoméndase especialmente a acetilación (acetilación do extremo N, o extremo C mantendo sempre un grupo carboxilo libre) para aumentar a carga negativa.Non obstante, para os péptidos básicos (é dicir, cargados positivamente a pH 7), recoméndase especialmente a aminación (grupo amino libre no extremo N-terminal e aminación no extremo C-terminal) para aumentar a carga positiva.

2. Acurtar ou alongar moito a secuencia

Algunhas das secuencias conteñen un gran número de aminoácidos hidrófobos, como Trp, Phe, Val, Ile, Leu, Met, Tyr e Ala, etc. Cando estes residuos hidrófobos superan o 50%, normalmente non son fáciles de disolver.Pode ser útil alongar a secuencia para aumentar aínda máis os polos positivo e negativo do péptido.A segunda opción é regular á baixa o tamaño da cadea peptídica para aumentar os polos positivo e negativo regulando á baixa os residuos hidrófobos.Canto máis fortes sexan os lados positivo e negativo da cadea peptídica, máis probable é que reaccione coa auga.
3. Poñer un residuo soluble en auga
Para algunhas cadeas peptídicas, a combinación dalgúns aminoácidos positivos e negativos pode mellorar a solubilidade en auga.A nosa empresa recomenda que o extremo N ou o extremo C dos péptidos ácidos se combine con Glu-Glu.Deuse o extremo N ou C do péptido básico e despois Lys-Lys.Se o grupo cargado non se pode colocar, Ser-Gly-Ser tamén se pode colocar no extremo N ou C.Non obstante, este enfoque non funciona cando non se poden cambiar os lados da cadea peptídica.